公司是具有高校背景的上海本地上市公司，主营业务为医药、软件与园区房产等。公司与复旦大学合资成立的复旦复华科技创业基金的第一个投资项目正是国内首创的抗口蹄疫病毒疫苗项目，该项目目前已通过了国家农业部兽药评审委员会的一类新兽药初评，填补了一项国际空白。公司第一大股东复旦大学拥有全国优秀的芯片研发人才，并拥有着我国唯一的专用集成电路和芯片国家重点实验室。依托第一大股东，公司成功介入微电子IC产业，由其自主设计的“中视一号”数字电视地面传输芯片生产成功，确立了在数字电视的龙头地位。
1984年11月,由复旦大学几位青年教师业余兼职，通过技术咨询、技术服务方式积累原始资本，成立非独立核算的复旦大学科技开发公司。
1992年6月,复旦大学科技开发总公司改制成为上海复华实业股份有限公司，并以公开募集的方式第一次向社会公众发行股票，成为全国高校第一家上市公司。
1993年1月5日,复华实业股票在上海证券交易所正式挂牌上市。
1999年底，复华实业基本完成公司产业结构的调整。
2001年6月，上海复华实业股份有限公司更名为上海复旦复华科技股份有限公司，进一步加强与复旦大学的合作。
2002年底，复旦复华形成了以软件开发、生物医药、园区房产、电源电器、教育咨询为主导产业的业务体系。
2006年5月，复旦复华完成股权分置改革。
2013年，拟以7.19元/股价格，非公开增发不超过6000万股股票，募集资金总额为不超4.31亿元。
公司从事医药业务的主要企业为上海复旦复华药业有限公司和江苏复旦复华药业有限公司。上海复旦复华药业有限公司主要从事药品的研发、生产和销售业务，业务涵盖化学原料药、化学药品制剂、中成药等。
药业公司专注于做专科药、特色药，围绕消化系统药物、神经系统用药物、抗肿瘤药物、循环系统药物等核心治疗领域，努力扩大重点产品的市场份额，打造了注射用还原型谷胱甘肽、双益平（石杉碱甲片）、氟他胺片、枸橼酸他莫昔芬片、雷公藤多苷片、心脑舒通片等一批深受市场欢迎的名优产品，主要产品在各自细分的治疗领域占有一定的市场地位。